各府省・独立行政法人等（府省別）
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本府省
地方支分部局
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- 東北厚生局
- 関東信越厚生局
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- 近畿厚生局
- 中国四国厚生局
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- 長崎労働局
- 熊本労働局
- 大分労働局
- 宮崎労働局
- 鹿児島労働局
- 沖縄労働局
施設等機関
- 国立がんセンター
- 国立循環器病センター
- 国立精神・神経センター
- 国立国際医療センター
- 国立成育医療センター
- 国立長寿医療センター
- 国立療養所松丘保養園
- 国立療養所東北新生園
- 国立療養所栗生楽泉園
- 国立療養所多磨全生園
- 国立駿河療養所
- 国立療養所長島愛生園
- 国立療養所邑久光明園
- 国立療養所大島青松園
- 国立療養所菊池恵楓園
- 国立療養所星塚敬愛園
- 国立療養所奄美和光園
- 国立療養所沖縄愛楽園
- 国立療養所宮古南静園
- 国立障害者リハビリテーションセンター
- 国立函館視力障害センター
- 国立塩原視力障害センター
- 国立神戸視力障害センター
- 国立福岡視力障害センター
- 国立伊東重度障害者センター
- 国立別府重度障害者センター
- 国立秩父学園
- 国立武蔵野学院
- 国立きぬ川学院
- 国立社会保障・人口問題研究所
- 国立感染症研究所
- 国立保健医療科学院
- 国立医薬品食品衛生研究所
- 小樽検疫所
- 仙台検疫所
- 成田空港検疫所
- 東京検疫所
- 横浜検疫所
- 新潟検疫所
- 名古屋検疫所
- 大阪検疫所
- 関西空港検疫所
- 神戸検疫所
- 広島検疫所
- 福岡検疫所
- 那覇検疫所
独立行政法人
- 国立健康・栄養研究所
- 国立病院機構
- 医薬品医療機器総合機構
- 医薬基盤研究所
- 労働安全衛生総合研究所
- 勤労者退職金共済機構
- 労働者健康福祉機構
- 高齢・障害者雇用支援機構
- 雇用・能力開発機構
- 福祉医療機構（ＷＡＭ ＮＥＴ）
- 国立重度知的障害者総合施設のぞみの園
- 労働政策研究・研修機構
- 年金積立金管理運用独立行政法人
